通过对政务中心组织结构的具体分析，发现它与传统意义的政府组织的结构之间存在巨大的区别。无论是从政务中心作为一个行政服务机构所具有的“临时编组性质”来说，还是从政务中心内部管理机构设置的扁平化和进驻政务中心的各职能部门组织结构的矩阵式而言。我省政务中心的行政组织结构都充满创新之处。创新大体归结为以下几个方面：

    首先，我省政务中心组织结构实现了从机械式到有机式的转变。有机式的组织横向结构占主导地位，呈现松散组织结构类型。为适应工作人员及行政环境的需要，组织的任务经常被重新确定，组织的规则较少，权力的产生主要是基于专业技术而不是等级制度。组织决策的产生是分散进行的，而不是由上级或中央决定的。组织的沟通方式是横向的，主要通过工作小组、团队和整合者来促进沟通。与传统政府组织结构在沟通、目标设置和决策等方面有重大区别。

    其次，我省政务中心的组织结构实现了从分工到合作的转变。设置原则实现了从“职能分工”为中心向“服务项目”为中心的转变。从服务于公民的角度出发，采用“一站式”“单窗口”的服务方式，内部组织结构必须具有非常好的合作与沟通机制。

   再次，政务中心组织结构实现从“高耸”型到“扁平”型的转变。职能部门将内部职能交叉、重叠、相近的科室归并为一个大科室进驻中心，减少行政管理层次，内部管理机构实行大处制，减少内部摩擦，降低管理成本和提高行政效率。

   此外，还采用“临时编组”的外在组织结构形式。进驻中心的部门存在较大灵活性，可以根据实际情况不断调整政务中心的组织规模，实现政务中心组织规模从封闭到开放的转变。决定政务中心在组织的学习能力方面具有较大优势。